Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atf3Q60765 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atf3Q60765 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atf3Q60765 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atf3Q60765 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atf3Q60765 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atf3Q60765 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atf3Q60765 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atf3Q60765 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atf3Q60765 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Atf3Q60765 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atf3Q60765 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atf3Q60765 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atf3Q60765 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atf3Q60765 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atf3Q60765 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atf3Q60765 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atf3Q60765 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atf3Q60765 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atf3Q60765 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atf3Q60765 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atf3Q60765 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atf3Q60765 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atf3Q60765 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Atf3Q60765 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms