Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms