Protein–RNA interactions for Protein: Q5XKE0

Mybpc2, Myosin-binding protein C, fast-type, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mybpc2Q5XKE0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mybpc2Q5XKE0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms