Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms