Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms