Protein–RNA interactions for Protein: Q5U901

Cpa6, Carboxypeptidase A6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpa6Q5U901 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cpa6Q5U901 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cpa6Q5U901 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cpa6Q5U901 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cpa6Q5U901 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Cpa6Q5U901 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpa6Q5U901 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpa6Q5U901 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpa6Q5U901 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpa6Q5U901 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpa6Q5U901 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpa6Q5U901 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpa6Q5U901 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpa6Q5U901 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpa6Q5U901 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpa6Q5U901 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpa6Q5U901 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpa6Q5U901 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpa6Q5U901 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpa6Q5U901 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpa6Q5U901 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpa6Q5U901 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpa6Q5U901 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpa6Q5U901 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms