Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim38Q5SZ99 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim38Q5SZ99 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim38Q5SZ99 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim38Q5SZ99 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim38Q5SZ99 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Trim38Q5SZ99 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Trim38Q5SZ99 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Trim38Q5SZ99 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Trim38Q5SZ99 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim38Q5SZ99 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Trim38Q5SZ99 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim38Q5SZ99 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Trim38Q5SZ99 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Trim38Q5SZ99 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim38Q5SZ99 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Trim38Q5SZ99 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim38Q5SZ99 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim38Q5SZ99 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim38Q5SZ99 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Trim38Q5SZ99 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim38Q5SZ99 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim38Q5SZ99 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim38Q5SZ99 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim38Q5SZ99 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim38Q5SZ99 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim38Q5SZ99 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim38Q5SZ99 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim38Q5SZ99 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim38Q5SZ99 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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