Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms