Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms