Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms