Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trdv4Q5R1A3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms