Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms