Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim41Q5NCC3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms