Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJS3

Fam20c, Extracellular serine/threonine protein kinase FAM20C, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20cQ5MJS3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam20cQ5MJS3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms