Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG9

Znf488, Zinc finger protein 488, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf488Q5HZG9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf488Q5HZG9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms