Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnni3kQ5GIG6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms