Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SynaQ5G5D5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms