Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWH3

Grhl3, Grainyhead-like protein 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grhl3Q5FWH3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grhl3Q5FWH3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grhl3Q5FWH3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grhl3Q5FWH3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grhl3Q5FWH3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grhl3Q5FWH3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grhl3Q5FWH3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Grhl3Q5FWH3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grhl3Q5FWH3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grhl3Q5FWH3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Grhl3Q5FWH3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grhl3Q5FWH3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grhl3Q5FWH3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grhl3Q5FWH3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grhl3Q5FWH3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grhl3Q5FWH3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grhl3Q5FWH3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grhl3Q5FWH3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grhl3Q5FWH3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grhl3Q5FWH3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grhl3Q5FWH3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grhl3Q5FWH3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grhl3Q5FWH3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grhl3Q5FWH3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grhl3Q5FWH3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grhl3Q5FWH3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Grhl3Q5FWH3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grhl3Q5FWH3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grhl3Q5FWH3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grhl3Q5FWH3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grhl3Q5FWH3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grhl3Q5FWH3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grhl3Q5FWH3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grhl3Q5FWH3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grhl3Q5FWH3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grhl3Q5FWH3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grhl3Q5FWH3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Grhl3Q5FWH3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grhl3Q5FWH3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Grhl3Q5FWH3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grhl3Q5FWH3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Grhl3Q5FWH3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms