Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ecm2Q5FW85 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ecm2Q5FW85 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
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