Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBG8

Uncharacterized protein C1orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5EBG8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q5EBG8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q5EBG8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q5EBG8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q5EBG8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q5EBG8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q5EBG8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q5EBG8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q5EBG8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q5EBG8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q5EBG8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q5EBG8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q5EBG8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q5EBG8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q5EBG8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q5EBG8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q5EBG8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q5EBG8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q5EBG8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q5EBG8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q5EBG8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms