Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms