Protein–RNA interactions for Protein: Q504M2

Pdp2, MCG53395, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdp2Q504M2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdp2Q504M2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdp2Q504M2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdp2Q504M2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdp2Q504M2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdp2Q504M2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdp2Q504M2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdp2Q504M2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdp2Q504M2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdp2Q504M2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdp2Q504M2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdp2Q504M2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdp2Q504M2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdp2Q504M2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdp2Q504M2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdp2Q504M2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdp2Q504M2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdp2Q504M2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdp2Q504M2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdp2Q504M2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdp2Q504M2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdp2Q504M2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdp2Q504M2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdp2Q504M2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdp2Q504M2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdp2Q504M2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdp2Q504M2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdp2Q504M2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdp2Q504M2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdp2Q504M2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdp2Q504M2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdp2Q504M2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdp2Q504M2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdp2Q504M2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdp2Q504M2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdp2Q504M2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdp2Q504M2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdp2Q504M2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdp2Q504M2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdp2Q504M2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdp2Q504M2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdp2Q504M2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdp2Q504M2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdp2Q504M2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdp2Q504M2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdp2Q504M2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdp2Q504M2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdp2Q504M2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdp2Q504M2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdp2Q504M2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdp2Q504M2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdp2Q504M2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdp2Q504M2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdp2Q504M2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdp2Q504M2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdp2Q504M2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdp2Q504M2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdp2Q504M2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdp2Q504M2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdp2Q504M2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdp2Q504M2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdp2Q504M2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdp2Q504M2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdp2Q504M2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdp2Q504M2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdp2Q504M2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdp2Q504M2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdp2Q504M2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdp2Q504M2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdp2Q504M2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdp2Q504M2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdp2Q504M2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdp2Q504M2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdp2Q504M2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdp2Q504M2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdp2Q504M2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdp2Q504M2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdp2Q504M2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdp2Q504M2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdp2Q504M2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdp2Q504M2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdp2Q504M2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdp2Q504M2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdp2Q504M2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdp2Q504M2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdp2Q504M2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdp2Q504M2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdp2Q504M2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdp2Q504M2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdp2Q504M2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdp2Q504M2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdp2Q504M2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pdp2Q504M2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdp2Q504M2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdp2Q504M2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdp2Q504M2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdp2Q504M2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdp2Q504M2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdp2Q504M2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdp2Q504M2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms