Protein–RNA interactions for Protein: Q4VAA2

Cdv3, Protein CDV3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdv3Q4VAA2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdv3Q4VAA2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdv3Q4VAA2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdv3Q4VAA2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdv3Q4VAA2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdv3Q4VAA2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdv3Q4VAA2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdv3Q4VAA2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdv3Q4VAA2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdv3Q4VAA2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdv3Q4VAA2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdv3Q4VAA2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdv3Q4VAA2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdv3Q4VAA2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdv3Q4VAA2 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdv3Q4VAA2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdv3Q4VAA2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdv3Q4VAA2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdv3Q4VAA2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdv3Q4VAA2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdv3Q4VAA2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdv3Q4VAA2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdv3Q4VAA2 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdv3Q4VAA2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdv3Q4VAA2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdv3Q4VAA2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdv3Q4VAA2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdv3Q4VAA2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdv3Q4VAA2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdv3Q4VAA2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdv3Q4VAA2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdv3Q4VAA2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdv3Q4VAA2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdv3Q4VAA2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdv3Q4VAA2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdv3Q4VAA2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdv3Q4VAA2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdv3Q4VAA2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdv3Q4VAA2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdv3Q4VAA2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdv3Q4VAA2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdv3Q4VAA2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdv3Q4VAA2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdv3Q4VAA2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdv3Q4VAA2 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdv3Q4VAA2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdv3Q4VAA2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdv3Q4VAA2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdv3Q4VAA2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdv3Q4VAA2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdv3Q4VAA2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdv3Q4VAA2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdv3Q4VAA2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdv3Q4VAA2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdv3Q4VAA2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdv3Q4VAA2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdv3Q4VAA2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdv3Q4VAA2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdv3Q4VAA2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdv3Q4VAA2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdv3Q4VAA2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdv3Q4VAA2 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdv3Q4VAA2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdv3Q4VAA2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdv3Q4VAA2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdv3Q4VAA2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdv3Q4VAA2 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdv3Q4VAA2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdv3Q4VAA2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdv3Q4VAA2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdv3Q4VAA2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdv3Q4VAA2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdv3Q4VAA2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdv3Q4VAA2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdv3Q4VAA2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdv3Q4VAA2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdv3Q4VAA2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdv3Q4VAA2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdv3Q4VAA2 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdv3Q4VAA2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdv3Q4VAA2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdv3Q4VAA2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdv3Q4VAA2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdv3Q4VAA2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdv3Q4VAA2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdv3Q4VAA2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdv3Q4VAA2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdv3Q4VAA2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdv3Q4VAA2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdv3Q4VAA2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdv3Q4VAA2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdv3Q4VAA2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdv3Q4VAA2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdv3Q4VAA2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdv3Q4VAA2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdv3Q4VAA2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdv3Q4VAA2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdv3Q4VAA2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdv3Q4VAA2 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdv3Q4VAA2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms