Protein–RNA interactions for Protein: Q497J0

BC100530, MCG130175, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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BC100530Q497J0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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BC100530Q497J0 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC100530Q497J0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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BC100530Q497J0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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BC100530Q497J0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC100530Q497J0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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