Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pydc3Q3V3Q4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pydc3Q3V3Q4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pydc3Q3V3Q4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pydc3Q3V3Q4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pydc3Q3V3Q4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pydc3Q3V3Q4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pydc3Q3V3Q4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pydc3Q3V3Q4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pydc3Q3V3Q4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pydc3Q3V3Q4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms