Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms