Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnpc3Q3UZ01 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rnpc3Q3UZ01 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms