Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms