Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc114Q3UX62 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc114Q3UX62 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc114Q3UX62 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc114Q3UX62 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc114Q3UX62 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc114Q3UX62 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc114Q3UX62 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc114Q3UX62 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms