Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Pfdn4Q3UWL8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn4Q3UWL8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms