Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms