Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV31

Rnf223, RING finger protein 223, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf223Q3UV31 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf223Q3UV31 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms