Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chpf2Q3UU43 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chpf2Q3UU43 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms