Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
B230104I21RikQ3USW4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
B230104I21RikQ3USW4 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
B230104I21RikQ3USW4 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
B230104I21RikQ3USW4 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
B230104I21RikQ3USW4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
B230104I21RikQ3USW4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
B230104I21RikQ3USW4 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
B230104I21RikQ3USW4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
B230104I21RikQ3USW4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
B230104I21RikQ3USW4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
B230104I21RikQ3USW4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
B230104I21RikQ3USW4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
B230104I21RikQ3USW4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
B230104I21RikQ3USW4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
B230104I21RikQ3USW4 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
B230104I21RikQ3USW4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
B230104I21RikQ3USW4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
B230104I21RikQ3USW4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
B230104I21RikQ3USW4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
B230104I21RikQ3USW4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
B230104I21RikQ3USW4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
B230104I21RikQ3USW4 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B230104I21RikQ3USW4 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B230104I21RikQ3USW4 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B230104I21RikQ3USW4 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B230104I21RikQ3USW4 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
B230104I21RikQ3USW4 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B230104I21RikQ3USW4 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
B230104I21RikQ3USW4 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
B230104I21RikQ3USW4 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
B230104I21RikQ3USW4 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms