Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Znf48Q3US17 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Znf48Q3US17 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
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Znf48Q3US17 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf48Q3US17 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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