Protein–RNA interactions for Protein: Q3URI6

Zfp560, Zinc finger protein 560, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp560Q3URI6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp560Q3URI6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms