Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms