Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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D13Ertd608eQ3UPR8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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D13Ertd608eQ3UPR8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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D13Ertd608eQ3UPR8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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D13Ertd608eQ3UPR8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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D13Ertd608eQ3UPR8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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D13Ertd608eQ3UPR8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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D13Ertd608eQ3UPR8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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D13Ertd608eQ3UPR8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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D13Ertd608eQ3UPR8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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D13Ertd608eQ3UPR8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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