Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPE3

Rmi2, RecQ-mediated genome instability protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmi2Q3UPE3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rmi2Q3UPE3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms