Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms