Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc61Q3UJV1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc61Q3UJV1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms