Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp19Q3UJD6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp19Q3UJD6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp19Q3UJD6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp19Q3UJD6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp19Q3UJD6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp19Q3UJD6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp19Q3UJD6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp19Q3UJD6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp19Q3UJD6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Usp19Q3UJD6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Usp19Q3UJD6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Usp19Q3UJD6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Usp19Q3UJD6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms