Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHF3

Mier3, Mesoderm induction early response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mier3Q3UHF3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Mier3Q3UHF3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mier3Q3UHF3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mier3Q3UHF3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mier3Q3UHF3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mier3Q3UHF3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mier3Q3UHF3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mier3Q3UHF3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mier3Q3UHF3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mier3Q3UHF3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mier3Q3UHF3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mier3Q3UHF3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mier3Q3UHF3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mier3Q3UHF3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mier3Q3UHF3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mier3Q3UHF3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mier3Q3UHF3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Mier3Q3UHF3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mier3Q3UHF3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mier3Q3UHF3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Mier3Q3UHF3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mier3Q3UHF3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mier3Q3UHF3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mier3Q3UHF3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mier3Q3UHF3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mier3Q3UHF3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mier3Q3UHF3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mier3Q3UHF3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mier3Q3UHF3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mier3Q3UHF3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mier3Q3UHF3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mier3Q3UHF3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mier3Q3UHF3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mier3Q3UHF3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mier3Q3UHF3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mier3Q3UHF3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mier3Q3UHF3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mier3Q3UHF3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mier3Q3UHF3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mier3Q3UHF3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mier3Q3UHF3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms