Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHA3

Spg11, Spatacsin, mousemouse

Predictions only

Length 2,430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spg11Q3UHA3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Spg11Q3UHA3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Spg11Q3UHA3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spg11Q3UHA3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spg11Q3UHA3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Spg11Q3UHA3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Spg11Q3UHA3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spg11Q3UHA3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Spg11Q3UHA3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spg11Q3UHA3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spg11Q3UHA3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spg11Q3UHA3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Spg11Q3UHA3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spg11Q3UHA3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spg11Q3UHA3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spg11Q3UHA3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spg11Q3UHA3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spg11Q3UHA3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Spg11Q3UHA3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spg11Q3UHA3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Spg11Q3UHA3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Spg11Q3UHA3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Spg11Q3UHA3 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spg11Q3UHA3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spg11Q3UHA3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spg11Q3UHA3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Spg11Q3UHA3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spg11Q3UHA3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spg11Q3UHA3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spg11Q3UHA3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Spg11Q3UHA3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spg11Q3UHA3 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spg11Q3UHA3 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spg11Q3UHA3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spg11Q3UHA3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spg11Q3UHA3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spg11Q3UHA3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spg11Q3UHA3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spg11Q3UHA3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spg11Q3UHA3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spg11Q3UHA3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spg11Q3UHA3 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spg11Q3UHA3 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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