Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pid1Q3UBG2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms