Protein–RNA interactions for Protein: Q3UAW9

Brf2, Transcription factor IIIB 50 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf2Q3UAW9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brf2Q3UAW9 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Brf2Q3UAW9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brf2Q3UAW9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brf2Q3UAW9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brf2Q3UAW9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brf2Q3UAW9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Brf2Q3UAW9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Brf2Q3UAW9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brf2Q3UAW9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Brf2Q3UAW9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brf2Q3UAW9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Brf2Q3UAW9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brf2Q3UAW9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brf2Q3UAW9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brf2Q3UAW9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brf2Q3UAW9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brf2Q3UAW9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brf2Q3UAW9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brf2Q3UAW9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brf2Q3UAW9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Brf2Q3UAW9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Brf2Q3UAW9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brf2Q3UAW9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brf2Q3UAW9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brf2Q3UAW9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brf2Q3UAW9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brf2Q3UAW9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brf2Q3UAW9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brf2Q3UAW9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Brf2Q3UAW9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brf2Q3UAW9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brf2Q3UAW9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brf2Q3UAW9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brf2Q3UAW9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brf2Q3UAW9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brf2Q3UAW9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Brf2Q3UAW9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.05■□□□□ 0
Brf2Q3UAW9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Brf2Q3UAW9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Brf2Q3UAW9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Brf2Q3UAW9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Brf2Q3UAW9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Brf2Q3UAW9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Brf2Q3UAW9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Brf2Q3UAW9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Brf2Q3UAW9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Brf2Q3UAW9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brf2Q3UAW9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brf2Q3UAW9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Brf2Q3UAW9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Brf2Q3UAW9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Brf2Q3UAW9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brf2Q3UAW9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brf2Q3UAW9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brf2Q3UAW9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Brf2Q3UAW9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Brf2Q3UAW9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Brf2Q3UAW9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Brf2Q3UAW9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brf2Q3UAW9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brf2Q3UAW9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brf2Q3UAW9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brf2Q3UAW9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Brf2Q3UAW9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brf2Q3UAW9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brf2Q3UAW9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Brf2Q3UAW9 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Brf2Q3UAW9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Brf2Q3UAW9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Brf2Q3UAW9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brf2Q3UAW9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Brf2Q3UAW9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brf2Q3UAW9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brf2Q3UAW9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brf2Q3UAW9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brf2Q3UAW9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brf2Q3UAW9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brf2Q3UAW9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brf2Q3UAW9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Brf2Q3UAW9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brf2Q3UAW9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Brf2Q3UAW9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Brf2Q3UAW9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Brf2Q3UAW9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Brf2Q3UAW9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brf2Q3UAW9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brf2Q3UAW9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brf2Q3UAW9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brf2Q3UAW9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brf2Q3UAW9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brf2Q3UAW9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brf2Q3UAW9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Brf2Q3UAW9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Brf2Q3UAW9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brf2Q3UAW9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brf2Q3UAW9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brf2Q3UAW9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Brf2Q3UAW9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brf2Q3UAW9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms