Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

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Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Kdm4dQ3U2K5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm4dQ3U2K5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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