Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms