Protein–RNA interactions for Protein: Q3U213

Serac1, Protein SERAC1, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serac1Q3U213 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Serac1Q3U213 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Serac1Q3U213 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Serac1Q3U213 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Serac1Q3U213 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Serac1Q3U213 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Serac1Q3U213 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Serac1Q3U213 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Serac1Q3U213 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Serac1Q3U213 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Serac1Q3U213 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Serac1Q3U213 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Serac1Q3U213 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Serac1Q3U213 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Serac1Q3U213 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Serac1Q3U213 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Serac1Q3U213 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Serac1Q3U213 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Serac1Q3U213 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Serac1Q3U213 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Serac1Q3U213 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Serac1Q3U213 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Serac1Q3U213 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Serac1Q3U213 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Serac1Q3U213 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Serac1Q3U213 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Serac1Q3U213 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Serac1Q3U213 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Serac1Q3U213 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Serac1Q3U213 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Serac1Q3U213 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Serac1Q3U213 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Serac1Q3U213 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Serac1Q3U213 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Serac1Q3U213 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Serac1Q3U213 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Serac1Q3U213 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Serac1Q3U213 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Serac1Q3U213 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Serac1Q3U213 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Serac1Q3U213 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Serac1Q3U213 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms