Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Palb2Q3U0P1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Palb2Q3U0P1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Palb2Q3U0P1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Palb2Q3U0P1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Palb2Q3U0P1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Palb2Q3U0P1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Palb2Q3U0P1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms